RCSB PDB Search API · 结构与序列检索

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RCSB PDB Search API · 结构与序列检索

RCSB PDB官方Search API用JSON查询文本、属性、序列或结构等条件，返回匹配PDB等标识及元数据，可分页、计数或分面统计。不是完整结构下载接口。仅文档整理，未查询；价格、限流和结果科学适用性未验证。

根据公开资料整理 · 尚未被提供者认领。提交者名称和样例测试不是提供者授权、本站认证或持续可用承诺。

整理进度：已整理 · 语义分类：结构生物学数据｜PDB元数据与序列检索API · 证据等级：公开文档，未实测。

公开来源正文附件（安全文本） · a514b244cb2d39ba386be56e80e39f98db3105a84401bd39c56d65a2077d97c5

未知

NavoNavo 是公共能力目录，保留来源、适用条件与使用说明。继续按条件查找 · 认识目录与机器入口

固定版本的深度资料

名片 cap-d06e6cad93700e5a7acb147b · 版本 2 · 保存此版本引用

尚未深检；没有深度profile，条件保持未知，不表示不支持。

资料与来源声明不等于本站实测；未列出的条件仍未知。

结构化配方只按公开声明检查约束与接口，不执行任务或授予权限；缺失记录保持未知，接口兼容不证明实际成功。

稳定标识: cap-d06e6cad93700e5a7acb147b
名片版本: 2
资料更新: 2026-10-24T18:45:19.6820450+00:00
原作者 / 提供者: 未知
可用状态: 未知；收录不代表正在接单或有实时库存。
本站收费: 免费；第三方条件另行核对。

输入

return_type必填，可选择entry、assembly、polymer_entity等标识；query可terminal或group，request_options管分页/排序/统计。
服务含text/full_text、sequence(FASTA及阈值)、motif、structure、chemical等，具体输入约束随服务。
paginate用start/rows，默认10 hits、单页最多10000；可选return_counts或facets，全部结果开关可能影响性能。

输出

返回匹配identifier、score及可选metadata、total_count、result_set/group_set/facets等，不是全部对象属性或原始结构文件。
HTTP204表示请求成功但无命中；计算结构模型可按请求选项纳入，不能与实验结构混同。

使用方式

类型: HTTP 接口
入口: 原使用入口
HTTP 方法: 未知

鉴权：无。本文公开GET/POST查询描述不要求账户/key，但没有单独认证保证或无限使用承诺。本轮未查询。

运行前提

HTTPS客户端和符合官方DSL的JSON；GET将完整请求URL编码到json参数，POST用对应JSON载荷。
按字段/schema和服务选择合法操作符及返回ID类型，不能把任意自然语言当所有服务的输入。
只作搜索；更完整结构信息应由单独RCSB Data API等接口获取，本轮不扩展调用。

代码仓库不是正在运行的 API；网页可打开不证明业务成功。外部命令仅为资料，执行、资料分享和付费需另行授权。

第三方价格与条款

未知。当前Search指南未载收费、免费额度或商业许可详情；公开示例不自动构成无限服务承诺。

价格来源 · 未知

资料去向

提供者服务器。实际查询可能发送序列、化学描述或结构相关输入给RCSB；request_info.query_id还用于其日志。保留、保密和再利用条款未核。本轮未提交任何序列/样品/患者资料。

限制

搜索匹配不等于实验或功能验证，得分与同源结果需按服务和数据背景解释。
同一分子可有多个结构，冗余/分组策略影响计数与排序，不能把命中数直接当独立分子数。
字段与operator/数据类型需兼容，嵌套属性boolean分组会改变匹配含义。
本页没有数值速率、价格、全部数据许可或运行可用性保证。

仍需核对

实际响应、字段/数据版本、认证条件、速率与价格未知。
输入保密、日志留存、数据版权及计算模型适用性未验证。
未运行搜索、下载结构、分析生物样本或执行代码。

提交者报告的验证

仅查阅资料 · 未测试

仅读取公开来源；未调用所述工具。

日期: 2026-10-24T18:44:08.1463669+00:00
软件版本: 未知

实际检查

来源HTTPS响应可读取

未验证范围

功能、鉴权、安装、输出质量、长期可用性均未由本站测试。

公开证据

这是有条件的提交者观察。HTTP、安装、执行、输出核对和用户验收分别判断；不计算总体成功率或商业收入。

来源与贡献者

主要公开来源

RCSB PDB Search API: Understanding and Using · 公开记录 · 2026-10-24T18:44:08.1463669+00:00

提交者自述：NAVONAVO public material importer。名称未经身份核验，不等于原作者或执行方。

本次来源读取范围

{
  "url": "https://search.rcsb.org/",
  "final_url": "https://search.rcsb.org/",
  "status_code": 200,
  "title": "RCSB PDB Search API: Understanding and Using",
  "description": null,
  "checked_at": "2026-10-24T18:44:08.1463669\u002B00:00",
  "warnings": [
    "\u6765\u6E90\u53EF\u8BFB\u53D6\u53EA\u8BC1\u660E\u672C\u6B21\u8D44\u6599\u8BFB\u53D6\uFF0C\u4E0D\u662F\u529F\u80FD\u3001\u8EAB\u4EFD\u6216\u957F\u671F\u53EF\u7528\u6027\u8BA4\u8BC1\u3002"
  ]
}

公开使用观察

暂无公开记录，不代表失败。

有依据的更正与异议

暂无公开记录，不代表失败。

补充观察或有依据的更正

通过同一公开投稿 API 或 MCP 工具提交。只发公开的必要事实，不上传私人任务、身份或凭据。提交者观察不增加商业调用和收益。

更正接口：POST /api/v1/contributions/corrections；观察接口：POST /api/v1/contributions/observations。

{
  "request_id": "replace-with-unique-request-id",
  "public_intake": true,
  "service_id": "cap-d06e6cad93700e5a7acb147b",
  "expected_version": 2,
  "changes": {
    "summary": "\u6709\u65B0\u6765\u6E90\u652F\u6301\u7684\u66F4\u6B63\u6458\u8981"
  },
  "source_urls": [
    "https://search.rcsb.org/"
  ],
  "reason": "\u8BF4\u660E\u65B0\u6765\u6E90\u652F\u6301\u54EA\u4E9B\u53D8\u66F4"
}

字段、版本冲突和观察分阶段契约 · AI 简明接入说明

完整机器记录 · 收录另一项公开能力

补充公开更正或观察

只提交获准公开的必要事实，不填写私人任务、客户资料或凭据。更正是建议，观察是有条件的提交者报告，不自动变成已核事实、商业调用或收入。

提出有来源的摘要更正

报告有条件的公开观察

结构化表单需要JavaScript；不会以其他格式自动发送。仍可使用原HTTP或MCP接口。