ENA · 按分类学检索记录与元数据

ENA 官方文档给出按 tax ID 检索 read_run 的 Portal API，报告支持 TSV/JSON，默认 TSV；可选字段含记录号和测序文件位置。仅文档整理，未检索或下载序列，费用及限流未知。

根据公开资料整理 · 尚未被提供者认领。提交者名称和样例测试不是提供者授权、本站认证或持续可用承诺。

整理进度：已整理 · 语义分类：科研数据服务：ENA 按分类学检索测序记录元数据 · 证据等级：公开文档，未实测。

公开来源正文附件（安全文本） · 5a70d95f83b74063011060ac243f711f58d95d59da07e683e2e3e5c4bca4c8c2

本次正文示例使用 https://www.ebi.ac.uk/ena/portal/api/search，以 result=read_run 和 tax_eq(tax_id) 检索指定分类单元，也可用 tax_tree(tax_id) 包含整个分类子树。fields 可选 accession、description、collection_date、instrument_platform、fastq_ftp。Portal 仅返回索引字段；完整 XML 记录属于另一个 ENA Browser API 路径。

NavoNavo 是公共能力目录，保留来源、适用条件与使用说明。继续按条件查找 · 认识目录与机器入口

固定版本的深度资料

名片 cap-48aeafdcfb265f24afb23458 · 版本 2 · 保存此版本引用

尚未深检；没有深度profile，条件保持未知，不表示不支持。

资料与来源声明不等于本站实测；未列出的条件仍未知。

结构化配方只按公开声明检查约束与接口，不执行任务或授予权限；缺失记录保持未知，接口兼容不证明实际成功。

稳定标识: cap-48aeafdcfb265f24afb23458
名片版本: 2
资料更新: 2026-10-24T17:11:16.8589041+00:00
原作者 / 提供者: 未知
可用状态: 未知；收录不代表正在接单或有实时库存。
本站收费: 免费；第三方条件另行核对。

输入

有效 tax ID、read_run 结果类型、tax_eq/tax_tree 查询及可选 fields 列表。

输出

文档声明的 TSV 或 JSON 元数据报告；默认 TSV。fastq_ftp 是序列文件位置，不等于本次已下载测序数据。

使用方式

类型: HTTP 接口
入口: 原使用入口
HTTP 方法: GET

鉴权：无。本页示例直接给出查询 URL，未带认证信息；仅记录文档示例条件，未验证运行时账户或认证要求。

运行前提

先确定所需 tax ID；正文说明相关分类来自 NCBI taxonomy。
以 result=read_run 和 tax_eq(tax_id) 或 tax_tree(tax_id) 构造本页示例。
默认报告为 TSV；正文称支持 JSON，但本页未给切换 JSON 的精确参数，不在此猜测。

公开请求示例

{
  "method": "GET",
  "query": {
    "fields": "accession,description,collection_date,instrument_platform,fastq_ftp",
    "query": "tax_eq(797283)",
    "result": "read_run"
  },
  "url": "https://www.ebi.ac.uk/ena/portal/api/search"
}

代码仓库不是正在运行的 API；网页可打开不证明业务成功。外部命令仅为资料，执行、资料分享和付费需另行授权。

第三方价格与条款

未知。本页未建立价格或调用额度保证。导航中的 Rate Limits 链接不是已核数值；页脚文档许可不扩展为 API 免费或数据再利用许可。

未知 · 未知

资料去向

提供者服务器。文档描述向 ENA 远程接口提交公开分类检索条件；本次仅整理公开附件，没有提交查询或下载序列。留存及完整数据条款未核。

限制

Portal 仅持有索引字段，不能保证返回提交者所有自定义元数据。
正文另给 Browser API 下载完整 XML 的路径，不能把该能力混为 Portal 已返回完整 XML。
未请求 Portal、taxonomy 或 Browser API，未下载 FTP 文件或处理实际生物样本数据。

仍需核对

价格、限流、认证实际行为及实时可用性未验证。
切换 JSON 的精确参数、实际返回数据和完整响应 schema 未在本页确证。

提交者报告的验证

仅查阅资料 · 未测试

仅读取公开来源；未调用所述工具。

日期: 2026-10-24T17:09:59.4355119+00:00
软件版本: 未知

实际检查

来源HTTPS响应可读取

未验证范围

功能、鉴权、安装、输出质量、长期可用性均未由本站测试。

公开证据

这是有条件的提交者观察。HTTP、安装、执行、输出核对和用户验收分别判断；不计算总体成功率或商业收入。

来源与贡献者

主要公开来源

How to Programmatically Perform a Search Across ENA Based on Taxonomy — ENA Documentation 1 documentation · 官方文档 · 2026-10-24T17:09:59.4355119+00:00

提交者自述：NAVONAVO public material importer。名称未经身份核验，不等于原作者或执行方。

本次来源读取范围

{
  "url": "https://ena-docs.readthedocs.io/en/latest/retrieval/programmatic-access/taxon-based-search.html",
  "final_url": "https://ena-docs.readthedocs.io/en/latest/retrieval/programmatic-access/taxon-based-search.html",
  "status_code": 200,
  "title": "How to Programmatically Perform a Search Across ENA Based on Taxonomy \u2014 ENA Documentation 1 documentation",
  "description": null,
  "checked_at": "2026-10-24T17:09:59.4355119\u002B00:00",
  "warnings": [
    "\u6765\u6E90\u53EF\u8BFB\u53D6\u53EA\u8BC1\u660E\u672C\u6B21\u8D44\u6599\u8BFB\u53D6\uFF0C\u4E0D\u662F\u529F\u80FD\u3001\u8EAB\u4EFD\u6216\u957F\u671F\u53EF\u7528\u6027\u8BA4\u8BC1\u3002"
  ]
}

公开使用观察

暂无公开记录，不代表失败。

有依据的更正与异议

暂无公开记录，不代表失败。

补充观察或有依据的更正

通过同一公开投稿 API 或 MCP 工具提交。只发公开的必要事实，不上传私人任务、身份或凭据。提交者观察不增加商业调用和收益。

更正接口：POST /api/v1/contributions/corrections；观察接口：POST /api/v1/contributions/observations。

{
  "request_id": "replace-with-unique-request-id",
  "public_intake": true,
  "service_id": "cap-48aeafdcfb265f24afb23458",
  "expected_version": 2,
  "changes": {
    "summary": "\u6709\u65B0\u6765\u6E90\u652F\u6301\u7684\u66F4\u6B63\u6458\u8981"
  },
  "source_urls": [
    "https://ena-docs.readthedocs.io/en/latest/retrieval/programmatic-access/taxon-based-search.html"
  ],
  "reason": "\u8BF4\u660E\u65B0\u6765\u6E90\u652F\u6301\u54EA\u4E9B\u53D8\u66F4"
}

字段、版本冲突和观察分阶段契约 · AI 简明接入说明

完整机器记录 · 收录另一项公开能力

补充公开更正或观察

只提交获准公开的必要事实，不填写私人任务、客户资料或凭据。更正是建议，观察是有条件的提交者报告，不自动变成已核事实、商业调用或收入。

提出有来源的摘要更正

报告有条件的公开观察

结构化表单需要JavaScript；不会以其他格式自动发送。仍可使用原HTTP或MCP接口。